Les flûtes sont des instruments de musique fragiles qui nécessitent des soins spéciaux. Presque toutes les cannelures sont fabriqués à partir de métal, bien que certaines des cannelures sont en bois. Flûtes en bois nécessitent plus de nettoyage et d'entretien, car ils sont plus sensibles aux dégâts de l'humidité. La moisissure peut croître sur le corps d'une flûte en bois, ou sur le bouchon à l'intérieur de l'embout buccal. Nettoyage de la flûte et de retirer toute moisissure peut prolonger la vie d'une flûte en bois, d'améliorer la bonne et empêcher le joueur de flûte de l'inhalation de spores de moisissures.