Si votre ordinateur a perdu des données en raison de panne de disque dur ou un conflit de logiciel, vous pouvez restaurer votre bibliothèque multimédia iTunes en utilisant un disque dur externe ou sur des disques de sauvegarde créés avant la perte de données. Dans iTunes 7.0 et plus tard, le programme dispose d'une fonction de sauvegarde qui vous offre la possibilité de sauvegarder l'ensemble de la bibliothèque, les achats sur l'iTunes Store, ou de nouveaux contenus. Selon Tony Bove et Cheryl Rhodes auteurs, "iPod & iTunes For Dummies," votre bibliothèque iTunes doit être sauvegardé sur une base fréquente en cas de perte de données.