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Comment faire arbres phylogénétiques

Un arbre phylogénétique est une représentation graphique des relations évolutives qui démontre comment les organismes pourraient éventuellement ont divergé d'un ancêtre commun. Auparavant, cela a été fait grâce à la comparaison de l'anatomie et de la physiologie des organismes et des fossiles vivants, mais maintenant, l'information génétique prélevé à partir de séquences nucléotidiques d'ADN est couramment utilisé. Organismes avec quelques similitudes peuvent être trouvées sur le séparée "branches" d'un arbre phylogénétique et ceux avec les points communs spécifiques serait situé sur "brindilles" de la même branche. Un arbre phylogénétique est un procédé pour la compréhension des espèces et des changements évolutifs dans les organismes.

Contenu

Choses que vous devez

Conseils & avertissements

Choses que vous devez

L'ensemble de données (par exemple, des séquences nucléotidiques, organisme photos)
Tableau d'affichage
Colle

Stylo
Ordinateur (pour les procédures de la séquence nucléotidique avancés uniquement)

Instructions

1

Une vache peut être l'organisme modèle pour la construction d'un arbre phylogénétique.
Sélectionnez un organisme modèle pour la comparaison de la relation. Cela peut se faire avec une séquence espèce, race ou nucleotides qui représente un organisme. Un exemple organisme pourrait être une vache. Le reste de l'arbre serait de démontrer comment étroitement liée est une vache à d'autres organismes sur la base de caractéristiques génétiques.
2

Poissons font un bon outgroup, car ils ne sont pas étroitement liés aux vaches.

Choisissez une outgroup. Un groupe externe est un organisme ou une séquence nucléotidique très différent moins étroitement liés. Si l'organisme modèle est une vache, puis un outgroup possible serait un poisson. Les deux plus différents organismes sont, le plus bas sur l'arbre phylogénétique sera leur point de branche divergente. Le temps est représenté avec la date la plus ancienne au bas du tableau et de nos jours être au sommet de l'organigramme. Le placement des branches montre à peu près quand dans le passé un trait évolutif éventuellement changé un organisme ancestral dans des espèces différentes.

3

"-Avoir quatre jambes"- est une façon de caractériser les organismes distincts en groupes.
Déterminer un ensemble de caractéristiques à utiliser pour la comparaison. Des exemples comprennent "a quatre pattes," "mâche CUD," "donne naissance vivante" ou "pousse des cheveux." Les séquences nucléotidiques sont des représentations simplement alphabétiques de l'ADN qui détermine les caractéristiques, donc une autre option serait: "contient la séquence ATGGACACGGA."
4

Diviser les organismes basés sur les caractéristiques. Quand un organisme ne contient pas le trait désiré, un branchement est réalisé dans l'arbre phylogénétique. Pour la characterisitic "a quatre pattes," vaches, les moutons et les cerfs seraient tous sur une branche, tandis que les poissons seraient sur une branche séparée. Collez l'image ou de la séquence d'une vache dans le coin supérieur du panneau d'affichage et le poisson dans le coin opposé et tracer deux lignes d'eux à la base du papier dans une forme d'intersection V.
5

Les moutons peuvent être séparé de cerfs et les vaches par la caractéristique de laine.
Continuer séparant les organismes modèles ou séquences nucléotidiques jusqu'à ce que chaque exemple a une seule séparation de la branche dans une brindille. La caractéristique "a la laine" séparerait moutons de cerfs et des vaches sur une branche singulière. Placez l'image de la moutons près l'image du poisson et tracez une ligne qui relie en forme de V vers le bas pour la branche de la vache. Utilisation de la caractéristique "a queue touffue" délimiterait vache de cerfs. Collez l'image du cerf entre la vache, de brebis et dessinez une autre ligne en forme de V qui coupe au-dessus des lignes de pêche et de moutons. Lorsque chaque espèce a une seule branche, l'arbre phylogénétique a été achevée.

Conseils & Avertissements

Choisissez un ensemble fini d'organismes ou de séquences.
Choisissez caractéristiques ou des séquences qui divisent les organismes en groupes séparés.
Avoir de multiples supports caractéristiques pour démontrer les relations de l'organisme.

Position phylogénétique peut être débattue sur la base de nombreuses caractéristiques, et beaucoup de soutien est nécessaire pour des choix de placement. Équations mathématiques peuvent être nécessaires pour démontrer la probabilité statistique des changements évolutifs. Probabilité de divergence sur le niveau génétique laisse la place à d'éventuelles inexactitudes dans les arbres phylogénétiques.

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